Si tienes activados los Windows Previews de Compiz Fusion seguramente te molestarán los tooltips o mensajitos que se muestran al pasar el ratón por encima de algún elemento del panel de Gnome o de KDE. Gracias al blog de OpenCompisiting me acabo de enterar de un truquito para hacerlos desaparecer. Realmente no desaparecen, sino que estableces su opacidad a 0, por lo que se vuelven completamente transparentes y no los ves:

Ve al CompizConfig Settings Manager -> General Options -> Opacity Settings y en la ventana Window Opacities pulsa sobre el botón Añadir y añade esta línea si estás en Gnome:
(name=gnome-panel & type=tooltip)
o esta otra si estás en KDE:
(name=kicker & type=tooltip)
¡Y listo!